Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPREP23469 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPREP23469 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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