Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MYF6P23409 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MYF6P23409 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MYF6P23409 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYF6P23409 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MYF6P23409 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms