Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD53P19397 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD53P19397 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD53P19397 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD53P19397 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms