Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP2A2P16615 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP2A2P16615 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms