Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLBP1P12271 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLBP1P12271 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms