Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMP1P11279 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms