Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GLI4P10075 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GLI4P10075 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GLI4P10075 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GLI4P10075 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms