Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI3P10071 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI3P10071 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms