Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFLP07196 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms