Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA1P02647 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOA1P02647 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms