Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HLA-DQB1P01920 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HLA-DQB1P01920 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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