Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HPRP00739 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HPRP00739 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HPRP00739 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HPRP00739 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPRP00739 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPRP00739 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPRP00739 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPRP00739 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HPRP00739 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HPRP00739 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms