Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL2O95198 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.1 ms