Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OFD1O75665 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OFD1O75665 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
OFD1O75665 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OFD1O75665 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms