Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCATO75600 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCATO75600 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCATO75600 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCATO75600 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms