Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPLO60437 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPLO60437 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPLO60437 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPLO60437 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPLO60437 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPLO60437 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms