Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TSPAN4O14817 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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TSPAN4O14817 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TSPAN4O14817 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TSPAN4O14817 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TSPAN4O14817 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TSPAN4O14817 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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