Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TVP23AA6NH52 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms