Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC160A6NGH7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms