Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PALM3A6NDB9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PALM3A6NDB9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PALM3A6NDB9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PALM3A6NDB9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PALM3A6NDB9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
PALM3A6NDB9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PALM3A6NDB9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms