Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms