Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms