Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX6Q9UPM6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms