Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC12A4Q9UP95 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms