Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms