Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RARRES3Q9UL19 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms