Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIMS3Q9UJD0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIMS3Q9UJD0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms