Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms