Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms