Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms