Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4CQ9C0C4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms