Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM2Q9C040 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms