Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BBS2Q9BXC9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BBS2Q9BXC9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms