Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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