Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPAS2Q99743 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NPAS2Q99743 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms