Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGPD5Q99666 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms