Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms