Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDK5RAP3Q96JB5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms