Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms