Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms