Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms