Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC4Q8WW27 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms