Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms