Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC4Q8TBB5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC4Q8TBB5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms