Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms