Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGSF1Q8N6C5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms