Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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LNX2Q8N448 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LNX2Q8N448 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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