Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms