Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms