Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms